Un simple prélèvement nasal peut fournir une alerte précoce des virus émergents


Comme l’a montré la pandémie de COVID-19, de nouveaux virus potentiellement dangereux peuvent commencer à se propager dans la population bien avant que le système mondial de surveillance de la santé publique ne puisse les détecter.

Cependant, les chercheurs de Yale ont découvert que tester la présence d’une seule molécule du système immunitaire sur des écouvillons nasaux peut aider à détecter des virus furtifs non identifiés dans les tests standard, rapportent-ils le 3 janvier dans le journal. Lancette Microbe.

« Trouver un nouveau virus dangereux, c’est comme chercher une aiguille dans une botte de foin », a déclaré Ellen Foxman, professeur agrégé de médecine de laboratoire et d’immunobiologie et auteur principal de l’étude. « Nous avons trouvé un moyen de réduire considérablement la taille de la botte de foin. »

Les responsables de la santé publique se tournent généralement vers quelques sources pour détecter les signes avant-coureurs d’une maladie émergente. Ils étudient les virus émergents chez les animaux susceptibles de transmettre l’infection à l’homme. Mais il est difficile de déterminer laquelle des centaines ou des milliers de nouvelles variantes virales représente un véritable danger. Et ils recherchent des épidémies de maladies respiratoires inexpliquées, c’est ainsi que le SRAS-Cov-2, le virus qui cause le COVID-19, a été découvert en Chine fin 2019.

Au moment où une épidémie d’un nouveau virus se produit, cependant, il peut être trop tard pour contenir sa propagation.

Pour la nouvelle étude, Foxman et son équipe ont revisité une observation faite dans son laboratoire en 2017, qui, selon eux, pourrait fournir une nouvelle façon de surveiller les agents pathogènes inattendus. Les écouvillons nasaux sont généralement prélevés sur des patients suspects d’infections respiratoires et sont testés pour détecter les signatures spécifiques de 10 à 15 virus connus. La plupart des tests reviennent négatifs. Mais comme l’a observé l’équipe de Foxman en 2017, dans quelques cas, les écouvillons de ceux qui ont été testés négatifs pour les virus « suspects habituels » présentaient toujours des signes d’activation des défenses antivirales, indiquant la présence d’un virus. Le signe révélateur était un niveau élevé d’une seule protéine antivirale fabriquée par les cellules qui tapissent les voies nasales.

Sur la base de cette découverte, les chercheurs ont appliqué des méthodes de séquençage génétique complètes à d’anciens échantillons contenant la protéine et, dans un échantillon, ont trouvé un virus grippal inattendu, appelé grippe C.

Les chercheurs ont également utilisé cette même stratégie consistant à retester d’anciens échantillons pour rechercher des cas manqués de COVID-19 au cours des deux premières semaines de mars 2020. Alors que des cas de virus avaient fait surface dans l’État de New York à peu près à la même époque, les tests n’étaient pas facilement disponibles. jusqu’à des semaines plus tard. Des centaines d’échantillons d’écouvillons nasaux prélevés sur des patients de l’hôpital de Yale-New Haven pendant cette période avaient été testés négatifs pour les virus de signature standard. Lorsqu’ils ont été testés pour le biomarqueur du système immunitaire, la grande majorité de ces échantillons n’ont montré aucune trace d’activité du système de défense antiviral. Mais quelques-uns l’ont fait; parmi ceux-ci, l’équipe a trouvé quatre cas de COVID-19 qui n’avaient pas été diagnostiqués à l’époque.

Les résultats révèlent que le test d’une protéine antivirale fabriquée par le corps, même si les tests pour les virus respiratoires connus sont négatifs, peut aider à identifier les prélèvements nasaux les plus susceptibles de contenir des virus inattendus.

Plus précisément, le dépistage du biomarqueur peut permettre aux chercheurs de restreindre la recherche d’agents pathogènes inattendus, ce qui rend possible la surveillance des virus inattendus à l’aide d’écouvillons prélevés lors des soins de routine aux patients. Les échantillons qui possèdent le biomarqueur peuvent être analysés à l’aide de méthodes de test génétique plus complexes pour identifier les agents pathogènes inattendus ou émergents circulant dans la population de patients et déclencher une réponse de la communauté des soins de santé.

Nagarjuna R. Cheemarla et Jason Bishai de Yale sont co-auteurs principaux de l’article, tout comme les anciens chercheurs de Yale, Amelia Hanron et Joseph R. Fauver.

Source de l’histoire :

Matériel fourni par Université de Yale. Original écrit par Bill Hathaway. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

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