Une nouvelle méthode pour étudier les protéines libérées par les cellules, qui pourrait conduire au développement de nouveaux outils pour suivre les maladies dont le cancer, a été développée par des scientifiques du Francis Crick Institute et de l’Imperial College de Londres.
Les biomarqueurs sont des outils très précieux qui permettent aux médecins d’étudier la biologie et la maladie, par exemple, de diagnostiquer une maladie à partir d’un échantillon de sang ou de tissu, de prédire si un traitement sera efficace chez un individu ou de voir quelle quantité d’un médicament atteint les cellules malades.
Mais trouver ces biomarqueurs est difficile. Pour aider à diagnostiquer la maladie, les scientifiques doivent identifier les protéines qui sont fabriquées uniquement par les cellules malades ou cancéreuses, mais qui ne sont pas libérées par les cellules saines.
Dans leur étude publiée dans Communication Nature Aujourd’hui (25 octobre), l’équipe a développé une nouvelle méthode qui identifie les protéines libérées par un type spécifique de cellule, même si les cellules se trouvent dans un environnement complexe avec de nombreux autres types de cellules.
« Lorsque vous avez un échantillon contenant différentes lignées cellulaires, il est très difficile d’identifier les protéines issues d’une lignée spécifique. Bien sûr, en laboratoire, nous pouvons créer des expériences avec un seul type de cellule, mais ces conditions ne reflètent pas ce qui se passe dans le corps où des interactions complexes entre les cellules pourraient affecter leur comportement et donc les protéines qu’elles libèrent », explique Ben Schumann, auteur principal et chef de groupe au Crick and Imperial College de Londres.
La nouvelle méthode est centrée sur l’ajout de marqueurs chimiques aux molécules de sucre qui sont ajoutées aux cellules. Alors que toutes les cellules absorbent le sucre, les chercheurs modifient génétiquement le type cellulaire qu’ils veulent étudier, afin que seul ce type ajoute le sucre à ses protéines. Lorsque les cellules fabriquent ces protéines, elles restent marquées de l’étiquette chimique, ce qui signifie que les chercheurs peuvent les identifier.
La méthode utilise la chimie bioorthogonale ou «clic» qui a reçu le prix Nobel de chimie de cette année. L’un des lauréats, Carbolyn Bertozzi de l’Université de Stanford, est co-auteur de cette étude. L’étiquette chimique est sélectionnée de sorte qu’elle « clique » avec une autre molécule qui aide les chercheurs à isoler les protéines souhaitées ou à leur ajouter une étiquette fluorescente.
Les chercheurs ont montré que leur méthode, appelée Bio-Orthogonal Cell line-specific Tagging of Glycoproteins (BOCTAG), fonctionnait dans des cultures cellulaires avec plusieurs lignées cellulaires et également chez des souris, où les chercheurs ont réussi à étiqueter des protéines de cellules cancéreuses particulières.
« Dans cette étude, nous avons examiné les protéines fabriquées par les cellules cancéreuses, mais notre méthode pourrait également être utilisée dans d’autres domaines, notamment l’immunologie ou l’étude des maladies infectieuses. le résultat d’interactions complexes dans le corps », explique Anna Cioce, première auteure et stagiaire postdoctorale au Crick.
« La prochaine étape pour notre équipe sera de continuer à développer cette méthode et d’en apprendre davantage sur la façon dont les cellules produisent différentes protéines en fonction de leur environnement », ajoute Ben.
Source de l’histoire :
Matériel fourni par L’Institut Francis Crick. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.
