L’association fongique avec des tumeurs peut prédire de pires résultats


La présence de certaines espèces fongiques dans les tumeurs prédit – et peut même contribuer à aggraver – les résultats du cancer, selon une étude menée par des chercheurs de Weill Cornell Medicine et de l’Université Duke.

L’étude, qui apparaît le 29 septembre dans Cellule, fournit un cadre scientifique pour développer des tests qui délimitent des espèces fongiques spécifiques dans les tumeurs qui sont pertinentes pour la prédiction de la progression du cancer et du traitement. Les résultats indiquent également la possibilité d’utiliser des traitements antifongiques pour compléter les traitements conventionnels contre le cancer dans certains cas.

« Ces découvertes ouvrent de nombreuses directions de recherche passionnantes, du développement de diagnostics et de traitements aux études des mécanismes biologiques détaillés des relations fongiques avec les cancers », a déclaré l’auteur principal, le Dr Iliyan Iliev, professeur agrégé d’immunologie en médecine dans la division. de gastroentérologie et d’hépatologie et membre de l’Institut Jill Roberts pour la recherche sur les maladies inflammatoires de l’intestin à Weill Cornell Medicine.

Le premier auteur de l’étude était Anders Dohlman, doctorant en génie biomédical à l’Université Duke.

L’idée que les virus et les bactéries peuvent déclencher ou accélérer le développement du cancer est maintenant bien établie. Cependant, on sait peu de choses sur les rôles liés au cancer des champignons – qui, comme les bactéries et les virus, colonisent l’intestin, les poumons, la peau et d’autres tissus barrières, interagissent avec le système immunitaire et provoquent parfois des maladies.

Dans la nouvelle étude, les chercheurs ont catalogué les espèces fongiques et leurs associations avec différents cancers en analysant The Cancer Genome Atlas, la plus grande base de données génomique bien annotée des tumeurs humaines.

L’analyse a révélé que l’ADN de certaines espèces fongiques est relativement abondant dans certains types de tumeurs. Ces espèces comprennent, dans les tumeurs gastro-intestinales, Candida tropicalis et Candida albicans, qui provoque le muguet et les infections à levures ; dans les tumeurs pulmonaires, espèces du genre fongique Blastomyces; et dans les tumeurs mammaires, espèces du champignon Malassezia.

Les chercheurs ont mis au point des méthodes de calcul sophistiquées pour exclure l’ADN fongique susceptible de provenir d’une contamination en laboratoire et ont pu confirmer, en particulier, la présence d’organismes vivants. Candidose espèces dans les échantillons de tumeurs colorectales.

Leur analyse a lié des niveaux plus élevés de Candidose dans les tumeurs gastro-intestinales à l’activité des gènes tumoraux favorisant l’inflammation et la réduction de l’adhérence cellule à cellule – caractéristiques associées à la propagation tardive du cancer à des organes distants, connues sous le nom de métastases. Plus haut Candidose les niveaux de ces tumeurs étaient également directement associés à un taux plus élevé de métastases.

Les résultats, selon les chercheurs, suggèrent que des niveaux élevés de champignons particuliers dans les biopsies tumorales pourraient un jour être utilisés comme biomarqueurs, indiquant, par exemple, un risque de métastase plus élevé, ce qui pourrait à son tour conduire au choix d’un traitement plus efficace.

Curieusement, les chercheurs ont souvent détecté l’ADN du même Candidose espèces dans les échantillons de tumeurs gastro-intestinales et les échantillons de sang appariés provenant des mêmes patients.

« Ces données sont passionnantes car elles jettent les bases de tests simples et peu coûteux pour Candidose ADN qui peut délimiter plus précisément le pronostic des cancers gastro-intestinaux et augmenter les biopsies d’ADN tumorales standard pour permettre une détection précoce de ces cancers avant que d’autres signes ne soient présents », a déclaré le co-auteur, le Dr Steven Lipkin, professeur de médecine Gladys et Roland Harriman et vice-président. chaire de recherche au département de médecine de Sanford et Joan Weill à Weill Cornell Medicine.Le Dr Lipkin est également chef du programme de génétique et d’épigénétique du cancer au Sandra and Edward Meyer Cancer Center et généticien clinique à NewYork-Presbyterian/Weill Cornell Medical Centre.

En théorie, les champignons associés aux tumeurs pourraient également être des cibles pour les thérapies antifongiques afin d’améliorer les résultats globaux du traitement. Cette perspective, cependant, repose sur une question non résolue : les champignons résidant dans la tumeur contribuent-ils à la malignité, peut-être en attisant l’inflammation, comme certaines bactéries sont connues pour le faire ? Ou les champignons sont-ils associés à certaines tumeurs uniquement parce que les tumeurs, à mesure qu’elles deviennent plus avancées, fournissent un environnement de plus en plus permissif pour la croissance fongique ?

Les chercheurs prévoient de poursuivre cette voie et d’autres pistes d’investigation dans d’autres études, a déclaré le Dr Iliev.

« Il est plausible que certains de ces champignons favorisent la progression tumorale et les métastases, mais même s’ils ne le sont pas, ils pourraient être très utiles en tant qu’indicateurs pronostiques », a-t-il déclaré.

La recherche dans le laboratoire Iliev est soutenue par des subventions des National Institutes of Health des États-Unis (R01DK113136, R01DK121977 et R01AI163007), le Cancer Research Institute, le Leona M. and Harry B. Helmsley Charitable Trust, le Irma T. Hirschl Career Scientist Award, le Crohn’s and Colitis Foundation et le prix PATH du Burroughs Wellcome Fund.

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