BOSTON: Les scientifiques ont tracé le premier atlas montrant comment le matériel génétique du nouveau coronavirus interagit avec les protéines des cellules humaines, une avancée qui pourrait fournir un point de départ pour le développement de nouveaux traitements contre Covid-19.
Selon les chercheurs, y compris ceux du Broad Institute aux États-Unis, l’une des tâches les plus urgentes est de comprendre toutes les interactions moléculaires entre le virus et les cellules qu’il infecte.
Ils ont expliqué qu’une compréhension détaillée de ces interactions aidera à identifier les processus dans les cellules hôtes qui favorisent la multiplication du virus et ceux qui activent le système immunitaire de l’hôte.
Alors que le virus SARS-CoV-2 utilise des protéines hôtes pour se répliquer, les scientifiques ont déclaré jusqu’à présent qu’il n’y avait aucune compréhension détaillée de toutes les protéines présentes dans les cellules humaines qui interagissent avec le matériel génétique viral – son ARN.
Dans la recherche actuelle, publiée dans la revue Nature Microbiology, les scientifiques ont créé le premier atlas mondial des interactions directes entre l’ARN du SRAS-CoV-2 et les protéines présentes dans les cellules humaines.
Sur la base des résultats, les chercheurs ont également identifié des régulateurs importants de la réplication virale.
Les scientifiques ont infecté des cellules humaines avec le nouveau coronavirus, purifié l’ARN viral et identifié les protéines qui y étaient liées.
«Dans ce cas particulier, nous avons pu effectuer des mesures quantitatives pour identifier les partenaires de liaison spécifiques les plus forts», a déclaré le co-auteur de l’étude Mathias Munschauer de l’Institut Helmholtz pour la recherche sur les infections à base d’ARN (HIRI) en Allemagne.
Les scientifiques ont déclaré que l’atlas des interactions ARN-protéines offre des informations uniques sur les infections par le SRAS-CoV-2, permettant la décomposition systématique des facteurs influençant la réplication du virus et des stratégies de défense de l’hôte – une condition préalable cruciale pour le développement de nouvelles thérapies.
À partir des résultats, les scientifiques ont identifié 18 protéines hôtes qui jouent un rôle important lors de l’infection par le SRAS-CoV-2, et ont trouvé 20 petites molécules susceptibles d’inhiber ces protéines.
Ils pensent que les deux protéines CNBP et LARP1 sont particulièrement intéressantes.
Les chercheurs ont également identifié des sites cibles dans ces protéines qui pourraient être utilisés pour inhiber la réplication du virus.
Selon Munschauer, la caractérisation de LARP1 en tant que facteur antiviral est une découverte majeure.
« La façon dont LARP1 se lie à l’ARN viral est très intéressante, car elle est similaire à la façon dont LARP1 régule certains ARN messagers cellulaires que nous connaissons déjà. Cela donne à son tour un aperçu des mécanismes d’action possibles », at-il ajouté.
Selon les scientifiques, trois petites molécules sur quatre qu’ils ont testées ont inhibé la réplication virale dans différents types de cellules humaines – des découvertes qui pourraient ouvrir de nouvelles façons de traiter Covid-19.
Selon les chercheurs, y compris ceux du Broad Institute aux États-Unis, l’une des tâches les plus urgentes est de comprendre toutes les interactions moléculaires entre le virus et les cellules qu’il infecte.
Ils ont expliqué qu’une compréhension détaillée de ces interactions aidera à identifier les processus dans les cellules hôtes qui favorisent la multiplication du virus et ceux qui activent le système immunitaire de l’hôte.
Alors que le virus SARS-CoV-2 utilise des protéines hôtes pour se répliquer, les scientifiques ont déclaré jusqu’à présent qu’il n’y avait aucune compréhension détaillée de toutes les protéines présentes dans les cellules humaines qui interagissent avec le matériel génétique viral – son ARN.
Dans la recherche actuelle, publiée dans la revue Nature Microbiology, les scientifiques ont créé le premier atlas mondial des interactions directes entre l’ARN du SRAS-CoV-2 et les protéines présentes dans les cellules humaines.
Sur la base des résultats, les chercheurs ont également identifié des régulateurs importants de la réplication virale.
Les scientifiques ont infecté des cellules humaines avec le nouveau coronavirus, purifié l’ARN viral et identifié les protéines qui y étaient liées.
«Dans ce cas particulier, nous avons pu effectuer des mesures quantitatives pour identifier les partenaires de liaison spécifiques les plus forts», a déclaré le co-auteur de l’étude Mathias Munschauer de l’Institut Helmholtz pour la recherche sur les infections à base d’ARN (HIRI) en Allemagne.
Les scientifiques ont déclaré que l’atlas des interactions ARN-protéines offre des informations uniques sur les infections par le SRAS-CoV-2, permettant la décomposition systématique des facteurs influençant la réplication du virus et des stratégies de défense de l’hôte – une condition préalable cruciale pour le développement de nouvelles thérapies.
À partir des résultats, les scientifiques ont identifié 18 protéines hôtes qui jouent un rôle important lors de l’infection par le SRAS-CoV-2, et ont trouvé 20 petites molécules susceptibles d’inhiber ces protéines.
Ils pensent que les deux protéines CNBP et LARP1 sont particulièrement intéressantes.
Les chercheurs ont également identifié des sites cibles dans ces protéines qui pourraient être utilisés pour inhiber la réplication du virus.
Selon Munschauer, la caractérisation de LARP1 en tant que facteur antiviral est une découverte majeure.
« La façon dont LARP1 se lie à l’ARN viral est très intéressante, car elle est similaire à la façon dont LARP1 régule certains ARN messagers cellulaires que nous connaissons déjà. Cela donne à son tour un aperçu des mécanismes d’action possibles », at-il ajouté.
Selon les scientifiques, trois petites molécules sur quatre qu’ils ont testées ont inhibé la réplication virale dans différents types de cellules humaines – des découvertes qui pourraient ouvrir de nouvelles façons de traiter Covid-19.
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